El Concejo Municipal de Santa Fe también cuenta con autoridades electas y cinco Comisiones Internas Permanentes, las cuales están conformadas por grupos de concejales y concejalas, y presididas por uno de ellos.
Las autoridades que integran el Concejo se clasifican en:
- Presidente: es uno de los concejales o concejalas, y es quien representa al Concejo en todas las relaciones exteriores. Tiene a su cargo el normal funcionamiento de los aspectos institucionales y de gobierno, así como los administrativos. Por otro lado, es quien reemplaza al Intendente cuando éste se ausenta, renuncia o es destituido.
- Vicepresidente Primero y Vicepresidente Segundo: también son concejales y concejalas electos por el resto del cuerpo.Y los secretarios, estos no son concejales o concejalas.
- Secretario Legislativo
- Secretario Administrativo
- Secretario de Finanzas
- Subsecretario Administrativo-Legislativo:
También se eligen:
- Presidentes de las Comisiones Internas Permanentes.
- Secretarios de Comisión: cada Comisión Permanente tiene un Secretario, a cuyo cargo se encuentra la organización y despacho de los asuntos girados a la Comisión, de acuerdo a lo resuelto por los concejales y concejalas integrantes de las mismas.