El Concejo Municipal de Santa Fe cuenta con autoridades electas y cuatro Comisiones Internas Permanentes. Anualmente, elige sus Autoridades:

- Un Presidente, que es uno de los concejales o concejalas, electo por el resto del cuerpo. Es quien representa al Concejo en todas las relaciones exteriores y tiene a su cargo el normal funcionamiento del mismo, tanto en los aspectos institucionales y de gobierno, como en los administrativos. A su vez, es el presidente quien reemplaza al Intendente cuando éste se ausenta o, asume esta función, en caso de renuncia, vacancia o destitución.

- Un Vicepresidente Primero y un Vicepresidente Segundo, quienes también son concejales y concejalas electos por el resto del cuerpo.

- Un Secretario Legislativo, un Secretario Administrativo, un Secretario de Finanzas y un Subsecretario Administrativo-Legislativo, quienes no son concejales y concejalas.

También se eligen:

- Presidentes de las Comisiones Internas Permanentes, que son concejales y concejalas.

- Secretarios de Comisión: Cada Comisión Permanente tiene un Secretario a cuyo cargo se encuentra la organización y despacho de los asuntos girados a la Comisión, de acuerdo a lo resuelto por los concejales y concejalas integrantes de las mismas.

Comisiones Internas Permanentes del Concejo

Las Comisiones están formadas por grupos de concejales y presididas por uno de ellos y tienen días y horarios de reunión para la discusión de los proyectos que se han presentado. Estos proyectos pueden pasar por varias de Comisiones, dependiendo del tema a tratar.